与妊娠有关的各种子宫出血：子宫肥大症可见阴道流血量多，但无停经史，亦无早孕反应;而与妊娠有关的各种子宫出血，如流产、葡萄胎等，均有停经史，且妊娠试验、B超检查均有助于鉴别诊断。

功能失调性子宫出血：功能失调性子宫出血患者，子宫出血多无规律性，且多发生于青春期及更年期，子宫无增大或仅稍许增大。

子宫肥大症容易与小的壁间肌瘤或宫腔内粘膜下肌瘤混淆。此症亦表现为子宫增大、月经过多，但双合诊可发现子宫质硬或有凹凸不平感。通过B超检查，可明确诊断。